Пётр Великий... -
один есть целая всемирная история
Александр Сергеевич Пушкин
Вторая Исаакиевская церковь, в камне, была заложена в августе 1717 года. Пётр I собственноручно заложил первый камень в основание новой церкви во имя Исаакия Далматского. Вторая Исаакиевская церковь строилась в стиле «петровского барокко» по проекту видного зодчего петровской эпохи Георга Маттарнови. После его кончины в 1719 году строительство возглавил Николай Гербель. Завершал строительство в 1728 году Михаил Земцов.
По облику церковь напоминала Петропавловский собор, это сходство ещё более усиливалось благодаря стройной колокольне с часами-курантами в третьем ярусе, привезёнными Петром I из Амстердама вместе с часами для Петропавловского собора. Шпиль на колокольне и купол были построены по проекту ван Болеса.
Расположение церкви рядом с Невой, берег которой ещё не был укреплён, было выбрано явно неудачно (как установил при её обследовании в 1760 году архитектор Адмиралтейской коллегии Савва Чевакинский). Вода из Невы, а также вода, сбрасываемая из «Адмиралтейского дома», подмывала фундамент здания. Чевакинский констатировал невозможность сохранения здания и церковь решили разобрать и построить новую дальше от берега.